Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lrrc9Q8CDN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lrrc9Q8CDN9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrrc9Q8CDN9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms