Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4f1Q8CCE9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms