Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIZ1

Anks1b, Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1bQ8BIZ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1bQ8BIZ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1bQ8BIZ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms