Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Clec18aQ7TSQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms