Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap2lQ7TS74 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap2lQ7TS74 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms