Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot1Q6ZQ08 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms