Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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