Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trak1Q6PD31 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trak1Q6PD31 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trak1Q6PD31 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms