Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20917Q62457 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms