Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q504N7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q504N7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q504N7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q504N7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q504N7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q504N7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q504N7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q504N7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q504N7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q504N7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q504N7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q504N7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q504N7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q504N7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q504N7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q504N7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q504N7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q504N7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q504N7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q504N7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q504N7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q504N7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q504N7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q504N7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q504N7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q504N7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms