Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Pacs2Q3V3Q7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms