Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc27Q3V036 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc27Q3V036 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc27Q3V036 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms