Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaaf3Q3UYV8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms