Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5113Q3UGK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5113Q3UGK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms