Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ulk3Q3U3Q1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms