Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43aQ3TL54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43aQ3TL54 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms