Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpusd2Q149F1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpusd2Q149F1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms