Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lingo4Q149C3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo4Q149C3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo4Q149C3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms