Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Col17a1Q07563 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col17a1Q07563 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Col17a1Q07563 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Col17a1Q07563 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms