Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms