Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htr1fQ02284 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr1fQ02284 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms