Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stx2Q00262 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx2Q00262 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms