Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdh10P70408 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdh10P70408 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh10P70408 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms