Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Romo1P60603 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 512.2 ms