Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgd1P52734 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms