Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr1P51675 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms