Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms