Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa11P50709 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms