Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrp3P50462 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms