Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GastP48757 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GastP48757 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GastP48757 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GastP48757 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GastP48757 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GastP48757 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GastP48757 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GastP48757 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GastP48757 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GastP48757 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms