Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnga1P29974 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnga1P29974 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms