Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif5cP28738 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif5cP28738 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms