Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BgnP28653 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BgnP28653 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BgnP28653 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BgnP28653 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BgnP28653 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BgnP28653 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BgnP28653 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BgnP28653 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BgnP28653 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BgnP28653 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BgnP28653 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BgnP28653 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BgnP28653 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BgnP28653 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BgnP28653 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BgnP28653 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BgnP28653 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BgnP28653 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BgnP28653 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BgnP28653 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BgnP28653 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms