Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcb1aP21447 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcb1aP21447 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcb1aP21447 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms