Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrm1P12657 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms