Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tnp1P10856 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms