Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BlmO88700 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
BlmO88700 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BlmO88700 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BlmO88700 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BlmO88700 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BlmO88700 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BlmO88700 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BlmO88700 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
BlmO88700 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BlmO88700 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BlmO88700 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BlmO88700 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BlmO88700 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BlmO88700 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BlmO88700 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BlmO88700 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BlmO88700 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BlmO88700 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BlmO88700 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BlmO88700 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BlmO88700 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BlmO88700 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
BlmO88700 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BlmO88700 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BlmO88700 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BlmO88700 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
BlmO88700 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BlmO88700 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BlmO88700 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BlmO88700 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
BlmO88700 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BlmO88700 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BlmO88700 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BlmO88700 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BlmO88700 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BlmO88700 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BlmO88700 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BlmO88700 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BlmO88700 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BlmO88700 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BlmO88700 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BlmO88700 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BlmO88700 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
BlmO88700 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
BlmO88700 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BlmO88700 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BlmO88700 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BlmO88700 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BlmO88700 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BlmO88700 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BlmO88700 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BlmO88700 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
BlmO88700 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BlmO88700 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BlmO88700 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BlmO88700 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms