Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StrnO55106 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StrnO55106 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StrnO55106 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StrnO55106 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StrnO55106 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StrnO55106 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StrnO55106 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StrnO55106 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
StrnO55106 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StrnO55106 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StrnO55106 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
StrnO55106 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StrnO55106 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StrnO55106 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
StrnO55106 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
StrnO55106 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
StrnO55106 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StrnO55106 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StrnO55106 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StrnO55106 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StrnO55106 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StrnO55106 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StrnO55106 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StrnO55106 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StrnO55106 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms