Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc180J3QNE4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc180J3QNE4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms