Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34aG3UW52 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34aG3UW52 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms