Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28048F7BCN0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms