Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8444F6XS56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm8444F6XS56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms