Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21977F6U3N7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21977F6U3N7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21977F6U3N7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms