Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UtrnE9Q6R7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UtrnE9Q6R7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms