Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r68E9Q0V3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r68E9Q0V3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms