Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc62E9PVD1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms