Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc13D3YV10 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms