Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apba1B2RUJ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apba1B2RUJ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms