Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf3B2KF05 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf3B2KF05 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 576.5 ms