Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhox1B1APN4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox1B1APN4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms